微生物吸收紫外線后導致細胞內核蛋白分子結構發生變化，產生蛋白變性，DNA鏈斷裂，DNA分子間的交聯被破壞，胞嘧啶和尿嘧啶發生水合作用，出現腺嘧啶二聚體，二聚體的形成破壞了嘌呤和嘧啶的正常配對，從而改變了DNA的生物活性。結果帶來微生物新陳代謝的障礙，不能增殖并產生細胞破壞作用；引起菌體內蛋白質和酶的合成障礙，導致結構發生變異，功能遭到破壞，致使微生物死亡，從而達到消毒滅菌的目的。
浸沒式紫外線殺菌器廣泛用于：
   
    1、食品加工工業水體消毒，包括果汁、牛奶、飲料、、食用油及各類罐頭、冷飲制品等用水設備。
   
    2、**、各類實驗室用水消毒，以及高含量致病體廢水消毒。 
   
    3、生活用水消毒，包括居民住宅小區、辦公大樓、自來水廠、旅館餐廳等。
   
    4、生物化學制藥、化妝品生產用冷卻水消毒。
   
    5、水產品加工用水凈化消毒。