陽離子聚丙烯酰胺在制藥廠廢水處理可以使用，其效果一般是沉淀水中的雜質，因為制藥廠廢水有抗生素等成分，隨意排放對水質影響非常大，需要進行各工藝分階段處理。  
      制藥廠廢水的來源來自制藥廠，包括工藝廢水,機修、沖洗廢水，初期雨水，職工生活污水等。
      制藥廢水分為生物制藥廢水和化學制藥廢水。生物制藥廢水的特點是高濃度的有機物，COD,BOD值波動較大，廢水的BOD/COD值差異大，NH3-N濃度高，色度深，濃度大，ss高。化學制藥廢水的特點是COD高，含鹽量高PH值變化大，肺水中成分單一不利于微生物成長，含有有毒及不易降解的物質。